2021年1月21日，中國醫(yī)學科學院病原生物學研究所吳志強研究員等在Microbiome發(fā)表題為“Decoding the RNA viromes in rodent lungs provides new insight into the origin and evolutionary patterns of rodent-borne pathogens in Mainland Southeast Asia”的研究論文，該研究通過宏轉錄組研究，系統(tǒng)研究了東南亞地區(qū)代表性嚙齒目動物攜帶病毒組的基本特征。
迄今為止，絕大多數(shù)在人間流行的病毒性傳染病都來源于野生動物宿主或者媒介生物，如埃博拉病毒、拉沙熱病毒和當前全球大流行的新型冠狀病毒等。以往我們對野生動物攜帶病毒的總體特征缺乏系統(tǒng)性研究，在面對新發(fā)傳染病暴發(fā)時，不能快速檢測并溯源其源頭，因此，闡明與新發(fā)突發(fā)傳染病關聯(lián)性密切的野生動物及媒介生物攜帶的病毒組特征，并以此為基礎建立完善的監(jiān)測預警和溯源體系，是實現(xiàn)防控關口前移、新發(fā)傳染病防控由被動應付轉向主動應對的關鍵所在。
翼手目動物（蝙蝠）和嚙齒目動物（鼠類）數(shù)量多、分布廣，是引發(fā)動物源性人類新發(fā)傳染病的兩大類最主要的哺乳類野生動物。繼2016年在《ISME Journal》、2018年在《Microbiome》等雜志發(fā)表系列文章初步揭示了全國范圍內代表性蝙蝠和鼠類呼吸道/消化道病毒組特征后，為了解周邊地區(qū)潛在的野生動物病毒威脅，金奇課題組接續(xù)與泰國農(nóng)業(yè)大學等機構合作開展了東南亞地區(qū)嚙齒目動物攜帶病毒組特征的研究工作，通過對覆蓋泰國、老撾和柬埔寨三國18個省30個物種共計3284只鼠類和食蟲類等小動物的肺組織樣本開展的宏轉錄組學分析，發(fā)現(xiàn)東南亞地區(qū)的嚙齒目動物的病毒涉及98個病毒科（包含24個哺乳動物病毒科）和一大批未分類的RNA病毒，鑒定獲得了216個新病毒種/株。其中一些重要病毒如漢坦病毒、砂粒病毒、白蛉病毒、黃病毒和未分類RNA病毒等的發(fā)現(xiàn)為針對該類病毒的預警防控策略的制定提供了重要參考。上述研究為國際上首次針對東南亞地區(qū)開展大范圍、多鼠種、全病毒組的研究，該類數(shù)據(jù)和特征體系的構建不僅有助于全面了解動物病毒生態(tài)的多樣性，而且為構建動物源性傳染病預警、溯源診治體系提供了重要數(shù)據(jù)，為提升我國新發(fā)突發(fā)傳染病外防輸入能力提供了技術支撐。
該研究得到了國家科技重大專項（2018ZX10101001和 2018ZX10711001），國家自然科學基金（81772228）和中國醫(yī)學科學院醫(yī)學與健康科技創(chuàng)新工程（2020-I2M-CoV19-010, 2016-I2M-1-014和2017-I2MB&R-12）等項目的資助。金奇研究員和吳志強研究員為論文共同通訊作者，吳志強、韓業(yè)林和劉博為論文的共同第一作者。
論文鏈接：https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-020-00965-z
文圖|病原所
