病原生物學研究所衛(wèi)生部病原系統(tǒng)生物學重點實驗室金奇研究員團隊在我國嚙齒類動物呼吸道/消化道病毒組特征研究方面取得新進展，相關研究成果近日在Microbiome雜志發(fā)表，題為 “Comparative analysis of rodent and small mammal viromes to better understand the wildlife origin of emerging infectious diseases”。
新發(fā)傳染病往往對人類健康、社會穩(wěn)定和經(jīng)濟發(fā)展帶來巨大沖擊，因此其防控一直受到政府和社會的高度重視。據(jù)統(tǒng)計，引起全球各地病毒性新發(fā)傳染病疫情的病原體70%以上來自野生動物源性病毒的跨種感染。然而由于以往我們對野生動物病毒的背景及特征缺乏系統(tǒng)性的研究，當面對新發(fā)傳染病暴發(fā)時，嚴重制約了病因的診斷、溯源、防治以及采取有效的防控措施。因此，闡明與人類新發(fā)傳染病關聯(lián)性密切的野生動物病毒組特征，并以此為基礎建立新發(fā)傳染病監(jiān)測、預警、診治和溯源等防控體系，實現(xiàn)新發(fā)傳染病防控由被動應對轉(zhuǎn)向主動防控已成為全球傳染病防控和科學工作者的共識。2017年底《科學》雜志發(fā)表文章全面闡述了開展全球野生動物病毒組研究的意義。
翼手目動物（蝙蝠）和嚙齒目動物（鼠類）數(shù)量多、分布廣，是引發(fā)動物源性人類新發(fā)傳染病的兩大類最主要的哺乳類野生動物。金奇研究團隊繼2016年在《ISME Journal》等雜志發(fā)表系列文章揭示了全國范圍內(nèi)代表性蝙蝠呼吸道/消化道病毒組特征后，接續(xù)開展了中國境內(nèi)嚙齒目動物攜帶病毒組特征的研究工作，通過對覆蓋中國20個省市自治區(qū)和直轄市55個種共計3055只嚙齒動物等小動物樣本的病毒組篩查分析，利用得到的65.6GB的測序數(shù)據(jù)分析并經(jīng)過驗證，發(fā)現(xiàn)了這些小型哺乳動物病毒涉及70個病毒科（包含23個哺乳動物病毒科），鑒定獲得了超過600個新的型/亞型病毒，可分類為203個新的病毒種。其中一些重要病毒如漢坦病毒、砂粒病毒、冠狀病毒和動脈炎病毒等基因組結(jié)構(gòu)、分布地域和宿主等特征。
上述研究為國際上首次大范圍、多鼠種的病毒組研究，該類數(shù)據(jù)和特征體系的構(gòu)建不僅有助于全面了解動物病毒生態(tài)的多樣性，而且為構(gòu)建動物源性傳染病預警、溯源診治體系提供了重要基礎，為提升我國新發(fā)突發(fā)傳染病防控能力提供了技術支撐。此外，該項工作也為院校突發(fā)疫情和重大醫(yī)療任務等科技支撐能力建設等提供了保障。
該研究得到了中國醫(yī)學科學院醫(yī)學與健康科技創(chuàng)新工程“重要新發(fā)突發(fā)傳染病生物安全基礎與防控”（2016-I2M-1-014）以及國家自然科學基金等項目的支持。共同參與本研究的合作單位包括中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所、云南省寄生蟲病防治所、國際生態(tài)健康聯(lián)盟。論文第一作者為吳志強副研究員。
論文鏈接：https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-018-0554-9
（病原生物學研究所）
